La Asociación Sociedad Española para el Avance de la Psicología Clínica y de la Salud Siglo XXI surge con el ánimo de ser el referente de la Psicología Clínica y de la Salud en España, y de propiciar el avance científico y profesional en este ámbito de actividad de la psicología. Nace con ánimo de integración y con la pretensión de ser cauce de comunicación con todas aquellas sociedades que compartan los mismos fines.
La SEPCyS tuvo su Asamblea Constituyente el 4 de febrero de 2000. El 13 de enero de 2001 se celebró en Toledo su primera asamblea ordinaria que eligió el Comité Ejecutivo y aprobó las líneas generales de actuación de dicha Asociación.